著作目录<
一、小说创作：
《旅行者》（短篇小说，1989）《藤缠树》（长篇小说，2002）
《一个青年小说家的诞生》（长篇小说，2004）
二、报告文学：
《沉尸、流亡、二·二八》（1991）《幌马车之歌》（1991）
《寻访被湮灭的台湾史与台湾人》（1994）
《人间正道是沧桑》（1999）
《共产青年李登辉》（2000）
《天未亮——追忆一九四九年四·六事件(师院部分)》（2000）
《麦浪歌咏队——追忆一九四九年四·六事件(台大部分)》（2001）
《台湾好女人》（2001）
《消失在历史迷雾中的作家身影》（2001）
《红色客家人》（2003）、《红色客家庄》（2004）
《消失的台湾医界良心》（2005）
《二·二八野百合》（2006）
《青春战斗曲》（2006）
《消失在二·二八迷雾中的王添灯》（2008）
《战风车——一个作家的参选记事》（2009）
《老红帽》（2010）
《寻找祖国三千里》（2010）
《你是什么派》（2011）
三、台湾民众史：
《日据时期台湾学生运动,1913——1945》（1993）《白色恐怖》（1993）
《高雄县二·二八暨50年代白色恐怖民众史》（1997）
《50年代白色恐怖台北地区案件调查与研究》（1998）
四、影像纪录：
《我们为什么不歌唱》（50年代白色恐怖纪录电影，侯孝贤电影社，1995）《台湾思想起》40集（50年代白色恐怖纪录电视，T.V.B.S，1997）
五、改编电影：
《好男好女》（侯孝贤导演，1994）《悲情城市》（侯孝贤导演）
