在文化大革命中,汪东兴受极左思想的影响,做了许多错事。他长年担任中央专案组的负责人,中央一专、二专的档案都交由他来管理。刘少奇的很多材料都是他一手整出来的。一九六六年底,汪东兴送给毛主席一份揭发刘少奇的材料,指出刘少奇在新四军就和邓子恢等結伙,在一九四五年大作和平梦,一九四六年大搞和平民主新阶段,一九四九年要发展资本主义剥削,证明刘少奇的“修正主义路线是由来已久的”。汪东兴对刘少奇的揭发,说明汪东兴在打倒刘少奇的过程中起了关键的作用。
汪东兴追随林彪、江青一伙打击、迫害老干部,制造了许多冤案,文革后又迟迟不肯平反,很多老干部对他非常反感。
谭震林说:“主席已经决定解放我了,但汪东兴还是那样盛气凌人的对待我,教训我要重新做人,我都七十岁的人,怎么叫重新做人?不是我摆老资格,就是他这样的语气实在令人难受。”
陶铸的夫人曾志在回忆陶铸最后的岁月之时,也不客气地指责汪东兴:“哪里还有一个共产党人的味道,他多次催促陶铸快走,我说陶铸快不行了,能不能留在北京治疗,汪东兴虎着脸讲,保皇派嘛,要接受革命的斗争。他拒绝为我们向主席传达真实的情况。”
叶剑英被疏散到湖南时,汪东兴一个电话赶跑了叶帅,搞得叶帅老泪纵横。然而,为了粉碎四人帮,叶帅主动联合汪东兴,并且在后来扩大了的中央政治局会议上给汪东兴说话。